[답변] "그 많은 것 중에 하나만 뽑아라."가 더 자연스럽습니다. '제한된 범위'를 나타내는 조사 '에'를 써 "그 많은 것 중에 하나만 뽑아라."와 같이 쓸 수 있고, '전체와 부분의 관계'를 나타내는 '의'를 써 "그 많은 것 중의 하나만 뽑아라."를 쓸 수도 있지만, '뽑다'의 경우 뽑는 범위가 부사어로 제시되는 것이 좀 더 자연스럽습니다. 참고로, '출처'의 '에서'를 써 "그 많은 것 중에서 하나만 뽑아라."도 자연스럽게 쓸 수 있습니다.